Банк был зарегистрирован в 1994 году в Казани в форме товарищества с ограниченной ответственностью. Учредителями выступили ТОО «Риат», ТОО «Информед Казань», ТОО «Кулон», ТОО «Интех», Татарский республиканский комитет Общества Красного Креста и Красного Полумесяца, ТОО «Рея». В 2007 году организационно-правовая форма кредитной организации была преобразована в открытое акционерное общество. В аперле 2015 года организационно-правовая форма была изменена на ПАО. С января 2005 года входит в систему страхования вкладов.

Структура владения сложная, включает ряд юридических лиц: ООО «Свитиль», ООО «Капитал-ФАРМ», ООО «Креатив-Инвест», ОАО «НАСКО», ОАО «Нижнекамскнефтехим», ООО «Артуг-Финанс», ООО «ПО КАМА РЕ», ОАО «Артуг», НКО «Фонд «ТУГАН ИЛЬ», ООО «СК «НАСКО Жизнь». Банк не раскрывает до конца конечных владельцев. Согласно имеющимся данным, на текущий момент ключевыми акционерами выступают Ильдар Аипов (26,62%), депутат Госсовета Республики Татарстан Ильдус Мингазетдинов (16,88%), Министерство земельных и имущественных отношений Республики Татарстан (10,03%), ООО «Креатив-Инвест» (8,97%), ООО «РИА Волга» (7,96%), ООО «Капитал-ФАРМ» (6,41%), ООО «Паркингтрейд» (3,94%), ОАО «АК «Барс» (2,96%), миноритарии (9,90%).

Головной офис ИнтехБанка расположен в столице Татарстана — Казани, также банк располагает тремя филиалами (в Москве, Нижнекамске, Набережных Челнах), 16 дополнительными офисами, из которых десять размещены в Казани, три — в Набережных Челнах, два — в Нижнекамске и Альметьевске, и четырьмя оперкассами вне кассового узла. Согласно отчетности банка на 1 января 2015 года среднесписочная численность сотрудников составила 546 человек. Для обслуживания карт в распоряжении клиентов Интехбанка развитая сеть банкоматов, в которую входят 37 собственных устройств, а также доступны банкоматы банков-партнеров ОАО «Банк «Зенит» и ОАО «АКБ «Татфондбанк».